第九区

电影一开始以纪录片以及新闻快报的方式引导观众进入这个人类和外星人共存的世界，二十多年前，外星人首度造访地球。人类以为外星人会发动攻击，或是带来超先进科技，结果两者皆无。这些外星人是逃离家乡的难民，人类对他们的处置方法仍然争论不休，政府决定先将外星人安顿在南非的”第九区”。
然而人类对外星人的同情渐失，将这些维持治安的工作发包给民营的「国联总部」（Multi-National United ，简称MNU），这家公司根本不顾外星人的福利。倘若MNU可以修好外星人强大的武器，他们便能从中获利，却至今都不成功。而启动该项武器需要外星人的DNA。
外星族群与人类的冲突已经发展到最严重的关头，因为MNU开始驱除外星族群离开第九区，该公司的探员负责要将它们迁移到新营地。国联总部的当地负责人魏克斯染上外星人的病毒，DNA发生变化。魏克斯很快就成为通缉要犯，也是最有价值的逃亡者，因为他就是解开外星科技秘密的关键。如今魏克斯遭到排斥，众叛亲离，只能逃往第九区。
过去外星人电影都是外星人怀着恶意攻打地球，这次的外星人「虾怪」(貌似蟑螂和虾子的合体)却无恶意，反倒是人类在压迫外星人、还设立许多不准外星人出入的告示，将它们视为次等公民，显示人性贪婪自私邪恶的一面。